|   Panionios til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Panionios - FC Nordsjælland 2-1 | | | | 15.10.2003 | FC Nordsjælland - Panionios 0-1 | |
|  FC København til 2. runde (vandt 3-2 på straffe) | |
| | 24.09.2003 | Ferencvaros - FC København 1-1 | | | | 15.10.2003 | FC København - Ferencvaros 1-1 | |
|  Spartak Moskva til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Spartak Moskva - Esbjerg 2-0 | | | | 15.10.2003 | Esbjerg - Spartak Moskva 1-1 | |
|  Røde Stjerne Beograd til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | OB - Røde Stjerne Beograd 2-2 | | | | 15.10.2003 | Røde Stjerne Beograd - OB 4-3 | |
|  Brøndby til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Brøndby - Viktoria Zizkov 1-0 | | | | 15.10.2003 | Viktoria Zizkov - Brøndby 0-1 | |
|   Valencia til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | AIK Stockholm - Valencia 0-1 | | | | 15.10.2003 | Valencia - AIK Stockholm 1-0 | |
|   Dinamo Bukarest til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Dinamo Bukarest - Shakhtar Donetsk 2-0 | | | | 15.10.2003 | Shakhtar Donetsk - Dinamo Bukarest 2-3 | |
|   Maccabi Haifa til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Maccabi Haifa - Publikum Celje 2-1 | | | | 15.10.2003 | Publikum Celje - Maccabi Haifa 2-2 | |
|  Torpedo Moskva til 2. runde (vandt 3-2 på straffe) | |
| | 24.09.2003 | CSKA Sofia - Torpedo Moskva 1-1 | | | | 15.10.2003 | Torpedo Moskva - CSKA Sofia 1-1 | |
|   Perugia til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Dundee FC - Perugia 1-2 | | | | 15.10.2003 | Perugia - Dundee FC 1-0 | |
|   Lens til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Cementarnica Skopje - Lens 0-1 | | | | 15.10.2003 | Lens - Cementarnica Skopje 5-0 | |
|   Newcastle til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Newcastle - NAC Breda 5-0 | | | | 15.10.2003 | NAC Breda - Newcastle 0-1 | |
|   Benfica til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | La Louviere - Benfica 1-1 | | | | 15.10.2003 | Benfica - La Louviere 1-0 | |
|  Hearts til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Hearts - Zeljeznicar 2-0 | | | | 15.10.2003 | Zeljeznicar - Hearts 0-0 | |
|  FC Salzburg til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | FC Salzburg - Udinese 0-1 | | | | 15.10.2003 | Udinese - FC Salzburg 1-2 | |
|  Genclerbirligi til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Genclerbirligi - Blackburn 3-1 | | | | 15.10.2003 | Blackburn - Genclerbirligi 1-1 | |
|  FC Barcelona til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Matador Puchov - FC Barcelona 1-1 | | | | 15.10.2003 | FC Barcelona - Matador Puchov 8-0 | |
|  Dinamo Zagreb til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Dinamo Zagreb - MTK Budapest 3-1 | | | | 15.10.2003 | MTK Budapest - Dinamo Zagreb 0-0 | |
| Levski Sofia til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Hapoel Ramat-Gan - Levski Sofia 0-1 | | | | 15.10.2003 | Levski Sofia - Hapoel Ramat-Gan 4-0 | |
|  Teplice til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Kaiserslautern - Teplice 1-2 | | | | 16.10.2003 | Teplice - Kaiserslautern 1-0 | |
| Slavia Prag til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Sartid Smederevo - Slavia Prag 1-2 | | | | 15.10.2003 | Slavia Prag - Sartid Smederevo 2-1 | |
| Villarreal til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Villarreal - Trabzonspor 0-0 | | | | 15.10.2003 | Trabzonspor - Villarreal 2-3 | |
|  Hajduk Split til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Grasshoppers - Hajduk Split 1-1 | | | | 15.10.2003 | Hajduk Split - Grasshoppers 0-0 | |
|  Groclin til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Hertha Berlin - Groclin 0-0 | | | | 15.10.2003 | Groclin - Hertha Berlin 1-0 | |
| Liverpool til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Olimpija Ljubljana - Liverpool 1-1 | | | | 15.10.2003 | Liverpool - Olimpija Ljubljana 3-0 | |
|  Vålerengen til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Vålerengen - Grazer AK 0-0 | | | | 15.10.2003 | Grazer AK - Vålerengen 1-1 | |
|  Aris Saloniki til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Zimbru Chisinau - Aris Saloniki 1-1 | | | | 15.10.2003 | Aris Saloniki - Zimbru Chisinau 2-1 | |
| Debrecen til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Varteks - Debrecen 1-3 | | | | 15.10.2003 | Debrecen - Varteks 3-2 | |
| Dnipro til 2. runde | |
| | 25.09.2003 | Hamburger SV - Dnipro 2-1 | | | | 15.10.2003 | Dnipro - Hamburger SV 3-0 | |
| Bordeaux til 2. runde | |
| | 25.09.2003 | Bordeaux - Petrzalka 2-1 | | | | 15.10.2003 | Petrzalka - Bordeaux 1-1 | |
| Roma til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Roma - Vardar Skopje 4-0 | | | | 15.10.2003 | Vardar Skopje - Roma 1-1 | |
| Manchester City til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Manchester City - Lokeren 3-2 | | | | 15.10.2003 | Lokeren - Manchester City 0-1 | |
| Wisla Krakow til 2. runde | |
| | 25.09.2003 | Wisla Krakow - Nijmegen 2-1 | | | | 15.10.2003 | Nijmegen - Wisla Krakow 1-2 | |
| Molde til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Leiria - Molde 1-0 | | | | 15.10.2003 | Molde - Leiria 3-1 | |
| Dortmund til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Austria Wien - Dortmund 1-2 | | | | 15.10.2003 | Dortmund - Austria Wien 1-0 | |
| Auxerre til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Auxerre - Xamax 1-0 | | | | 15.10.2003 | Xamax - Auxerre 0-1 | |
|  Rosenborg til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Ventspils - Rosenborg 1-4 | | | | 15.10.2003 | Rosenborg - Ventspils 6-0 | |
| Gaziantepspor til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Gaziantepspor - Hapoel Tel-Aviv 1-0 | | | | 15.10.2003 | Hapoel Tel-Aviv - Gaziantepspor 0-0 | |
| Sporting Lissabon til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Sporting Lissabon - Malmö FF 2-0 | | | | 15.10.2003 | Malmö FF - Sporting Lissabon 0-1 | |
| FC Utrecht til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | FC Utrecht - MSK Zilina 2-0 | | | | 15.10.2003 | MSK Zilina - FC Utrecht 0-4 | |
| Parma til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Metalurg Donetsk - Parma 1-1 | | | | 15.10.2003 | Parma - Metalurg Donetsk 3-0 | |
|  Sochaux til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | MyPa-47 - Sochaux 0-1 | | | | 15.10.2003 | Sochaux - MyPa-47 2-0 | |
| Schalke 04 til 2. runde | |
| | 25.09.2003 | Kamen Ingrad - Schalke 04 0-0 | | | | 16.10.2003 | Schalke 04 - Kamen Ingrad 1-0 | |
|  Malorca til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | APOEL Nicosia - Mallorca 1-2 | | | | 15.10.2003 | Mallorca - APOEL Nicosia 4-2 | |
| Steaua Bukarest til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Southampton - Steaua Bukarest 1-1 | | | | 15.10.2003 | Steaua Bukarest - Southampton 1-0 | |
| Feyenoord til 2. runde | |
| | 25.09.2003 | Feyenoord - Kärnten 2-1 | | | | 16.10.2003 | Kärnten - Feyenoord 0-1 | |
| PAOK Saloniki til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | PAOK Saloniki - Lyn Oslo 0-1 | | | | 15.10.2003 | Lyn Oslo - PAOK Saloniki 0-3 | |
| FC Basel til 2. runde | |
| | 24.09.2003 | Malatyaspor - FC Basel 0-2 | | | | 15.10.2003 | FC Basel - Malatyaspor 1-2 | |
|
|
Forside