| Anderlecht til kvartfinaler med sammenlagt 9-0 (Derry City trak sig inden 2. kamp) | |
|
| 23.11.1965 | Anderlecht - Derry City 9-0 |
| 4. | 1-0 | Jozef Jurion |
| 12. | 2-0 | Paul van Himst |
| 44. | 3-0 | Wilfried Puis |
| 46. | 4-0 | Jan Mulder |
| 47. | 5-0 | Jan Mulder |
| 65. | 6-0 | Jan Mulder |
| 66. | 7-0 | Paul van Himst |
| 85. | 8-0 | Wilfried Puis | |
| 90. | 9-0 | Vacques Stockman |
|
| Inter til kvartfinaler med sammenlagt 3-2 | |
|
| 01.12.1965 | Dinamo Bukarest - Inter 2-1 | | 15.12.1965 | Inter - Dinamo Bukarest 2-0 |
| 12. | 0-1 | Joaquin Peiro | | 67. | 1-0 | Sandro Mazzola, straffe |
| 25. | 1-1 | Constantin Fratila | | 87. | 2-0 | Giacinto Facchetti |
| 51. | 2-1 | Ion Haidu |
|
| Ferencvaros til kvartfinaler med sammenlagt 3-1 | |
|
| 10.11.1965 | Ferencvaros - Panathinaikos 0-0 | | 17.11.1965 | Panathinaikos - Ferencvaros 1-3 |
| | | | | 8. | 0-1 | Janos Karaba |
| | | | | 27. | 0-2 | Mate Fenyvesi |
| | | | | 48. | 1-2 | Dimitrios Domazos |
| | | | | 63. | 1-3 | Florian Albert |
|
| Real Madrid til kvartfinaler med sammenlagt 7-3 | |
|
| 17.11.1965 | Kilmarnock - Real Madrid 2-2 | | 01.12.1965 | Real Madrid - Kilmarnock 5-1 |
| 21. | 1-0 | Thomas McLean, straffe | | 24. | 0-1 | Brian McIlroy |
| 25. | 1-1 | Pirri | | 26. | 1-1 | Ramon Grosso |
| 56. | 1-2 | Amancio Amaro | | 28. | 2-1 | Felix Ruiz |
| 60. | 2-2 | Jack McInally | | 37. | 3-1 | Ramon Grosso |
| | | | | 60. | 4-1 | Francisco Gento |
| | | | | 89. | 5-1 | Pirri |
|
| Benfica til kvartfinaler med sammenlagt 5-4 | |
|
| 10.11.1965 | Levski Sofia - Benfica 2-2 | | 08.12.1965 | Benfica - Levski Sofia 3-2 |
| 4. | 1-0 | Georgi Asparukhov | | 3. | 0-1 | Georgi Asparukhov |
| 22. | 1-1 | Eusebio | | 5. | 1-1 | Eusebio |
| 58. | 2-1 | Simeon Nikolov | | 28. | 2-1 | Mario Coluna |
| 66. | 2-2 | Eusebio | | 42. | 3-1 | Jose Torres |
| | | | | 76. | 3-2 | Georgi Asparukhov |
|
| Partizan Beograd til kvartfinaler med sammenlagt 3-1 | |
|
| 09.11.1965 | Partizan Beograd - Werder Bremen 3-0 | | 17.11.1965 | Werder Bremen - Partizan Beograd 1-0 |
| 69. | 1-0 | Fahrudin Jusufi | | 33. | 1-0 | Arnold Schütz |
| 75. | 2-0 | Mustafa Hasanagic |
| 88. | 3-0 | Josip Pirmajer |
|
| Sparta Prag til kvartfinaler med sammenlagt 5-1 | |
|
| 24.11.1965 | Sparta Prag - Gornik Zabrze 3-0 | | | Gornik Zabrze - Sparta Prag 1-2 |
| 36. | 1-0 | Andrej Kvasnak, straffe | | 17. | 0-1 | Ivan Mraz |
| 64. | 2-0 | Frantisek Jilek | | 67. | 0-2 | Ivan Mraz |
| 78. | 3-0 | Vaclav Vrana | | 73. | 1-2 | Zygfryd Szoltysik |
|
| Manchester United til kvartfinaler med sammenlagt 5-1 | |
|
| 10.11.1965 | Vorwärts Berlin - Manchester United 0-2 | | 08.12.1965 | Manchester United - Vorwärts Berlin 3-1 |
| 73. | 0-1 | Denis Law | | 19. | 1-0 | David Herd |
| 80. | 0-2 | John Connelly | | 39. | 2-0 | David Herd |
| | | | | 82. | 2-1 | Jürgen Piepenburg |
| | | | | 84. | 3-1 | David Herd |
|
|
|